贵州黑山羊DQB2基因Exonl遗传变异分析

作者: 黄兰 ; 康建兵 ; 钱成 ; 许厚强 ; 陈祥 ; 罗卫星

关键词: 贵州黑山羊 DQB2基因 SNPS 生物信息学

摘要：研究了贵州黑山羊MHC—DQB2基因的多态性，以便发挥MHC—DQB2基因在山羊抗病育种中的作用。采用构建DNA池并通过PCR直接测序的方法对164只贵州黑山羊的DQB2基因Exonl进行遗传变异分析；应用生物信息学软件分析基因频率、RNA二级结构、蛋白质二级结构和抗原表位。在其第1外显子中筛选得到4个SNPs，分别为G23A（Arg→Gln）、G45A（同义突变）、T90C（同义突变）、C109A（Gln→Lys），其中，T90C突变位点的最小自由能最低，其RNA二级结构最稳定。G23A和C109A2个突变位点均引起RNA二级结构、蛋白质二级结构和抗原表位的改变。结果表明：贵州黑山羊MttC—DQB2基因的第1外显子具有较丰富的遗传多样性。

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