猪PGRMC2基因启动子区多态性的生物信息学分析

作者: 金娉婷 [1] ; 王爱国 [1] ; 刘莉莉 [1] ; 叶健 [2] ; 蒋尧 [1] ; 王晓梅 [1] ; 张士媛 [1] ; 傅金銮 [1]

关键词: 猪PGRMC2基因 SNP 转录因子结合位点预测基因表达产仔数

摘要：本研究以大白猪的基因组DNA为模板,通过混池测序鉴定PGRMC2基因启动子区的多态位点（SNPs）,以分析该基因启动子区突变前后转录因子结合位点和Cp G岛的变化。运用生物信息学软件预测其核心启动子区域、转录因子结合及Cp G岛。结果表明：在220头大白猪个体中,检测到PGRMC2基因启动子区存在2个SNP位点,分别为C-1283 T和T-372 C。且这2个SNP均导致PGRMC2基因的转录因子结合发生改变。C-1283 T突变导致1个转录因子结合位点消失（即ASP-CYP21）;T-372C突变导致1个转录因子结合位点消失（AP-1-DNA_polyme）,9个新的转录因子结合位点产生（E1A-BS5、Trex/MEF3compo、E-box CS、Myo D-MCK-right、NFkappa E1site、NF-mu-E1CS、kappa-E2CS1、lambda5-site F、m TDT-site F等）。由此,推测SNPs可能对PGRMC2基因表达调控发挥重要作用。

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猪PGRMC2基因启动子区多态性的生物信息学分析

作者: 金娉婷 [1] ; 王爱国 [1] ; 刘莉莉 [1] ; 叶健 [2] ; 蒋尧 [1] ; 王晓梅 [1] ; 张士媛 [1] ; 傅金銮 [1]

关键词: 猪PGRMC2基因 SNP 转录因子结合位点预测 基因表达 产仔数

关键词: 猪PGRMC2基因 SNP 转录因子结合位点预测基因表达产仔数