鸭HDAC1基因编码区的分子克隆及生物信息分析

作者: 何桦 [1] ; 刘贺贺 [1] ; 王浩瀚 [1] ; 张荣萍 [1] ; 孙玲俐 [1] ; 李亮 [1] ; 王继文 [1]

关键词: 组蛋白乙酰化 HDAC1 分子克隆序列分析生物信息鸭

摘要：本研究利用RT—PCR方法获得了鸭HDAC1基因编码区（CDS）序列，结合生物信息学方法对鸭HDAC1序列进行了分析，并比较了其与人HDAC1二级结构和空间结构上的差异。结果表明：鸭HDAC1基因开放阅读框序列1440bp，编码479个氨基酸残基，与原鸡的同源性在核苷酸和氨基酸水平分别达到91．46％及93．53％，而与哺乳动物类及昆虫类同源性较低。HDAC1系统进化树表明，鸭HDAC1与原鸡聚在一支，而与哺乳动物人和小鼠遗传距离相对较近，并归类为一大支；鸭与人HDAC1二级结构扫修饰位点上也有一定差异，在亲、疏水性质方面又表现一致。鸭与人HDAC1功能也较类似，在氨基酸生物合成、中央中介代谢、转译、能量代谢等功能都具有调控功能，而鸭HDAC1在氨基酸生物合成明显高于人HDAC1在此方面功能的概率。以上结果提示，这些二级结构、空间结构上的差异所造成鸭与人HDAC1功能上的差异，有可能是研究鸭HDAC1的切入点，需要在后续研究中加以重视。

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鸭HDAC1基因编码区的分子克隆及生物信息分析

作者: 何桦 [1] ; 刘贺贺 [1] ; 王浩瀚 [1] ; 张荣萍 [1] ; 孙玲俐 [1] ; 李亮 [1] ; 王继文 [1]

关键词: 组蛋白乙酰化 HDAC1 分子克隆 序列分析 生物信息 鸭

关键词: 组蛋白乙酰化 HDAC1 分子克隆序列分析生物信息鸭