牛CIS基因启动子区SNP及生物信息学研究

作者: 杨永强 [1] ; 龚俞 [2] ; 焦仁刚 [2] ; 惠嫣婷 [1] ; 谢海强 [1] ; 刘若余 [1]

关键词: CIS SNP 启动子贵州荷斯坦奶牛务川黑牛

摘要：为筛选CIS基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响。选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明：CIS基因5′调控区3个SNPs位点,分别为G-726A、C-669T、C-82G;生物信息学软件预测得到CIS基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生;多态性位点对转录因子结合位点、RNA二级结构稳定性均有显著影响,但并不改变CpG岛大小。

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牛CIS基因启动子区SNP及生物信息学研究

作者: 杨永强 [1] ; 龚俞 [2] ; 焦仁刚 [2] ; 惠嫣婷 [1] ; 谢海强 [1] ; 刘若余 [1]

关键词: CIS SNP 启动子 贵州荷斯坦奶牛 务川黑牛

关键词: CIS SNP 启动子贵州荷斯坦奶牛务川黑牛