鸡NLRC5基因克隆及生物信息学分析

作者: 马腾 [1] ; 常国斌 [1] ; 陈蓉 [1] ; 张颖 [1] ; 戴爱琴 [1] ; 徐琪 [1] ; 陈福斌 [2] ; 朱金金 [2] ; 陈国宏 [1]

关键词: 基因克隆 NLRC5基因 RACE 生物信息学狼山鸡

摘要：本实验克隆了狼山鸡NLRC5基因CDS及UTR序列,对NLRC5核酸序列以及氨基酸序列特征进行分析,为进一步研究NLRC5在天然免疫系统中的功能奠定基础。采用RT-PCR方法扩增NLRC5的CDS,并通过RACE法扩增3′UTR和5′UTR,拼接成全长转录本,提交至GenBank,获得登录号：JQ044414。结果表明：鸡NLRC5基因序列与哺乳动物同源性较低,转录本全长7047nt,5′UTR 308 bp、3′UTR 1137 bp。基因定位在11号染色体,共49个外显子,转录本可能存在可变剪切体;基因上游2 kb包含C-Rel,AP-1等天然免疫信号通路重要转录因子结合位点和启动子元件;以及1个944 bp的CpG岛;其氨基酸序列包含与哺乳动物相似的NACHT及LRRs结构域,在靠近N端处包含NLS和NES,不包括其他类型信号肽,其蛋白可在胞质与核之间穿梭。表明鸡NLRC5的表达可能受到表观遗传的调控,在天然免疫及适应性免疫中的作用与哺乳动物相似。

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鸡NLRC5基因克隆及生物信息学分析

作者: 马腾 [1] ; 常国斌 [1] ; 陈蓉 [1] ; 张颖 [1] ; 戴爱琴 [1] ; 徐琪 [1] ; 陈福斌 [2] ; 朱金金 [2] ; 陈国宏 [1]

关键词: 基因克隆 NLRC5基因 RACE 生物信息学 狼山鸡

关键词: 基因克隆 NLRC5基因 RACE 生物信息学狼山鸡