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DMU、GBS和Herdsman3个软件育种值估计的比较
作者: 张越 杨宇泽 张金鑫 张锁宇 邱小田 唐韶青 丁向东 中国农业大学动物科学技术学院 农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室 国家畜禽育种工程实验室 北京100193 北京市畜牧总站 北京100029 全国畜牧总站 北京100125
关键词: 猪 育种软件 育种值 相关性
摘要:猪育种管理软件为猪育种工作和养猪场的管理提供了便利,育种值估计是育种管理系统的核心。但在实际应用中,不同软件育种值估计不一致给一线育种工作者带来了困扰。本研究选取国内广泛使用的GBS、Herdsman育种管理软件和科学研究中常用的DMU程序,以大白猪、长白猪和杜洛克猪的育种数据和模拟数据为材料,研究3款软件估计育种值之间的差异。结果表明:在数据和遗传评估模型及初始参数一致的情况下,DMU4和GBS由于采取相同的算法,估计育种值一致性高达O.99以上,DMU5育种值估计与DMU4高度一致;DMUAI基于约束极大似然方法,在相同条件下育种值估计准确性略高于DMU4和GBS;由于模型和初始参数未知,本研究Herdsman育种值估计与GBS和DMU一致性偏低。但鉴于Herdsman算法与DMU4和GBS一致,可以预测在相同模型下,GBS、Herdsman与DMU育种值估计应无差异。研究同时表明,软件对遗传评估评估结果影响不大,主要是具体遗传评估模型的配置。
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