3个品种猪MEF2D基因启动子多态及其生物信息学分析

作者: 白优 [1] 张勇 [1] 陈祥 [2] 张雄 [1] 李俊 [3] 何琦 [1] 杨红 [1] 陆静

关键词: 从江香猪 MEF2D基因 SNP 启动子生物信息学

摘要：研究以从江香猪、柱×长×大外三元杂交猪及贵州宗地花猪为研究对象,采用混合DNA池结合直接测序技术筛选猪MEF2D基因5'UTR及第1外显子区SNPs位点;同时利用生物信息学软件分析SNPs位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响.结果表明:在猪MEF2D基因5'UTR区共筛查到4个SNPs位点,分别为A-511G、T-453A、T-242G和T-180A;生物信息学软件预测发现T-453A和T-242G位点附近有重要转录因子结合位点消失和新位点生成,据此推测猪MEF2D基因5'UTR区的T-453A和T-242G位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响.

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3个品种猪MEF2D基因启动子多态及其生物信息学分析

作者: 白优 [1] 张勇 [1] 陈祥 [2] 张雄 [1] 李俊 [3] 何琦 [1] 杨红 [1] 陆静

关键词: 从江香猪 MEF2D基因 SNP 启动子 生物信息学

关键词: 从江香猪 MEF2D基因 SNP 启动子生物信息学