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我国6个地方鸭种的群体结构分析
作者: 张扬 [1] ; 陈阳 [1] ; 朱振 [1] ; 段修军 [2] ; 董飚 [2] ; 李欣钰 [3] ; 徐琪 [1] ; 陈国宏 [1]
关键词: 微卫星标记 群体结构 主成分分析 Structure程序 地方鸭品种
摘要:为深入揭示我国地方鸭种的群体遗传结构.本研究利用荧光标记微卫星引物结合ABI-3730XL型DNA测序平台,对国家级水禽基因库(泰州)保存的6个品种鸭(426只)在12个位点上的等位基因进行STR分型,利用SPSS19.0和Structure2.0软件对群体结构进行分析。结果表明:12个座位的多态性丰富,共检测到88个等位基因,PCA分析得到6个主成分,前4个主成分对群体分类的累积贡献率达到88.091%。Structure程序成功构建出了6个群体的遗传分化结构图和群体的独立类群分布图.推断6个群体在所属推断类别中的平均基因组分数分别为93.88%、96.08%、90.89%、93.01%、88.67%、92.65%:且未发现有个体发生迁移。Structure程序构建的系统发育树进一步显示临武鸭与攸县麻鸭、高邮鸭与山麻鸭和广西小麻鸭的遗传距离较近。
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