CODEHOP法设计简并引物克隆花羔红点鲑β-肌动蛋白基因及生物信息分析

作者: 卢玉婷 [1] ; 张雅斌 [2] ; 吉尚雷 [1] ; 王建超 [1] ; 郑伟 [2] ; 张培军 [3] ; 李月红 [1]

关键词: 简并引物 CODEHOP β-肌动蛋白

摘要：本研究克隆了花羔红点鲑β-肌动蛋白基因，结合生物信息学资源和生物软件的使用，利用CODEHOP法针对特定的氨基酸序列设计简并引物．克隆结果进行同源性分析并构建系统进化树。结果表明：应用此种方法设计出的引物简并度相对较低，Tm4g-的修改较为灵活，产物特异性强；β-肌动蛋白具有高度的保守性，比对结果与虹鳟同源性达99．8％，与大马哈鱼同源性达99．3％，与大西洋鲑同源性达99．8％，系统发育关系与传统的分类相一致。

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