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cDNA芯片筛选肉鸡胫骨软骨发育不良相关基因

作者: 田文霞 ; 刘红霞 ; 喻进 ; 卢晓晓 ; 宁官保 ; 李宏全

关键词: 福美双 胫骨软骨发育不良 cDNA芯片 差异表达基因 肉鸡

摘要:本研究旨在应用cDNA芯片技术筛选福美双诱导的肉鸡胫骨软骨发育不良(TD)相关基因,提取对照组和饲喂福美双组第2、4、8、10、15、20天的AA肉鸡生长板组织总RNA,制备cRNA探针,分别与cDNA芯片杂交,重新筛选肉鸡TD差异表达克隆.结果表明:得到第2、4、8、10、15、20天2.0倍以上差异表达克隆分别为151、90、240、589、718和733个,共计1 398个.基因本体分析表明,上述差异基因分别参与调节、信号转导、转录、RNA加工与修饰、翻译、蛋白折叠和蛋白水解、运输、氧化还原、生物合成、细胞周期、增殖分化、细胞凋亡、细胞粘附、免疫应答与防御反应、应激反应、电子链传递和糖基化等生物学过程;氧化磷酸化、糖酵解与糖异生、黏着斑、细胞骨架调节、ECM-受体相互作用、MAPK、钙信号转导通路、Wnt、胰岛素信号通路、TGF-β信号通路、泛素介导的蛋白水解、神经活性的配体-受体相互作用、VEGF、GnRH、酮体的合成与分解、细胞因子与其受体的相互作用等多条代谢途径与肉鸡TD有关.为从分子水平阐明肉鸡胫骨软骨发育不良发病机制提供可靠的生物信息学依据.


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