鸡IGF2基因多态性及蛋白相关分析

作者: 郭发荣 [1,2] ; 陈彬 [1,2] ; 李太山 [1,2] ; 张小卿 [1,2] ; 綦世金 [1,2]

关键词: IGF2基因 SNPS 系统发育生物信息学鸡

摘要：为全面了解IGF2基因的多态性、系统发育关系以及IGF2蛋白功能位点,本实验利用DNA池结合PCR产物直接测序法和生物信息学对9个鸡品种11种样本的IGF2基因进行系统研究。结果表明：共检测到IGF2基因的9个SNPs,其中3个错义突变导致蛋白性质发生改变;NJ树整体分为三大支,其中绿壳蛋鸡与其他品种遗传差异最大;突变后RNA二级结构、最小自由能和稳定性随之变化;IGF2蛋白存在典型跨膜螺旋区和信号肽,包含2个高度保守的结构功能域IIGF和IGF2-C;同源模建得到了理想可靠的IGF2蛋白三维结构模型。显示,IGF2基因遗传多样性相对较高,突变位点在各群体中分布不平衡,可为进一步研究IGF2蛋白功能奠定理论基础。

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鸡IGF2基因多态性及蛋白相关分析

作者: 郭发荣 [1,2] ; 陈彬 [1,2] ; 李太山 [1,2] ; 张小卿 [1,2] ; 綦世金 [1,2]

关键词: IGF2基因 SNPS 系统发育 生物信息学 鸡

关键词: IGF2基因 SNPS 系统发育生物信息学鸡