不同MHC-DRB1单倍型哈萨克绵羊感染包虫病初期小肠组织差异表达基因筛选与分析

作者: 李鑫 [1] ; 惠文巧 [1,2] ; 蒋松 [1] ; 贾斌 [1] ; 张永生 [1] ; 申红 [1] ; 李洪涛 [1] ; 王绪海 [1] ; 韩国华 [1] ; 刘帅兵 [1]

关键词: 哈萨克羊包虫病小肠差异基因生物信息学分析

摘要：前期研究发现哈萨克绵羊的单倍型MHC—DRB1基因单倍型Mvalbc—Sacllab—Hinllab与细粒棘球蚴病（包虫病）抗性密切相关，但具体分子抗病机制尚不明确。本研究旨在筛选和分析不同MHC基因型哈萨克绵羊感染包虫病早期小肠组织差异表达基因。以PCR—RFLP方法根据MHC—DRB1单倍型选择抗病和非抗痛哈萨克绵羊，将实验动物分为包虫病抗性组（A）、包虫病非抗性组（B）和健康对照组（C），A、B两组分别于人工感染包虫病后2、3、4h采集小肠组织，以C组为对照，采用基因芯片的方法分析不同各组问小肠差异表达基因结果表明：A组与C组相比差异表达的基因共4712个，其中表达量上调的有1959个，表达量下调的有2753个；B组与C组相比差异表达的基因4944个，其中2076个表达上调，2868个表达下调；同C相比，A和B同为上调或下调，且表达量差异显著的基因有141个，其中32个基因表达上调，109个基因表达下调。综上，差异基因主要涵盖了代谢、细胞进程等方面，KEGG分析显示出现频率最高的补体凝集素通路代谢途径值得关注。

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不同MHC-DRB1单倍型哈萨克绵羊感染包虫病初期小肠组织差异表达基因筛选与分析

作者: 李鑫 [1] ; 惠文巧 [1,2] ; 蒋松 [1] ; 贾斌 [1] ; 张永生 [1] ; 申红 [1] ; 李洪涛 [1] ; 王绪海 [1] ; 韩国华 [1] ; 刘帅兵 [1]

关键词: 哈萨克羊 包虫病 小肠 差异基因 生物信息学分析

关键词: 哈萨克羊包虫病小肠差异基因生物信息学分析