牦牛KAP3．3基因的克隆及生物信息学分析

作者: 王宏博 [1,2] ; 梁春年 [1] ; 包鹏甲 [1] ; 张良斌 [1] ; 裴杰 [1] ; 吴晓云 [1] ; 赵娟花 [1] ; 阎萍 [1]

关键词: 牦牛 KAP3 3蛋白 CDS区

摘要：本研究以牦牛的角蛋白关联蛋白3．3（KAP3．3）基因作为研究对象，通过查询GenBank中收录的黄牛KAP3．3基因的mRNA序列设计1对特异性引物，通过逆PCR、PCR以及基因克隆测序的方法首次获得牦牛的KAP3．3基因完整的CDS区序列，并对其进行生物信息学分析。结果表明：牦牛KAP3．3基因的CDS区为297bp，编码98个氨基酸；编码的蛋白质属于亲水性蛋白。二级结构含有延伸链、口转角以及无规卷曲3种。氨基酸序列与黄牛的完全一致，具有Keratin，high sulphur matrix protein家族的完整结构域。

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