椰子油对育成猪肝脏转录组高通量测序的影响

作者: 李建平 [1,2] ; 秦贵信 [1] ; 张巧灵 [3] ; 赵志辉 [4] ; 王大力 [4] ; 孙博兴 [4] ; 姜海龙 [1]

关键词: 椰子油高通量RNA测序差异表达基因肝脏育成猪

摘要：试验设计了椰子油组和对照组2个处理。采集育成猪肝脏组织,进行转录组高通量测序,找出2种处理间的差异表达基因及差异代谢通路。利用Illumina Hi SeqTM2 500高通量RNA-seq测序技术测序,使用Top Hat2软件将测序得到的reads序列与猪参考基因组（Sscrofa10.2）序列比对,找出差异表达基因,并在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果表明：椰子油组和对照组肝脏中差异表达基因共有487个,与对照组相比,椰子油组表达上调的基因有222个,下调的基因有265个。在差异表达上/下调前15位基因中,有多个基因是参考基因组中没有的新基因和功能未知基因。GO功能分类注释到细胞组成、分子功能和生物学过程数据库中的差异表达基因数分别有398、368个和398个;注释到KEGG通路中差异表达基因数188个。

上一篇：过量添加酿酒酵母培养物对肉仔鸡生长性能的影响
下一篇：复合生态菌固态发酵木薯渣工艺参数优化及混菌发酵对木薯渣营养品质的影响

椰子油对育成猪肝脏转录组高通量测序的影响

作者: 李建平 [1,2] ; 秦贵信 [1] ; 张巧灵 [3] ; 赵志辉 [4] ; 王大力 [4] ; 孙博兴 [4] ; 姜海龙 [1]

关键词: 椰子油 高通量RNA测序 差异表达基因 肝脏 育成猪

关键词: 椰子油高通量RNA测序差异表达基因肝脏育成猪